Мушки генитални систем састоји се и од спољашњег и од унутрашњег дела. Спољне мушке гениталије укључују пенис, уретру и скротум. Унутрашњи мушки гениталији укључују семену кесу, тестисе, васкуларни деференс, епидидимис, простату, булбоуретхрал жлезду и ејакулацијски канал.
Пенис је главни део спољашњих мушких гениталија, који има и сексуалне и телесне функције. У стању је да ејакулише сперму (која садржи сперму) током секса и да ослободи тело урина. Уретра транспортује урин из бешике, ван мушког тела. Семе такође путује кроз уретру.
Сваки мушкарац има две скроталне врећице у којима се налазе одређени делови унутрашњих мушких гениталија (епидидимис, тестиси и доњи сперматични канапи). Тестиси су најважнији део унутрашњих мушких гениталија јер праве и чувају сперму, као и снабдевају мушко тело хормонима који контролишу развој мушких карактеристика и репродуктивних органа.
Епидидимис складишти, сазрева и транспортује сперматозоиде између тестиса и васкуларног канала, који сперму усмерава према уретри. Семенски мехурићи су уз уретру и луче млечну течност која се на крају испушта кроз ејакулациони канал. Булбоуретхрал жлезде такође помажу у испуштању сперме.
